腸球菌是人醫(yī)和獸醫(yī)耐藥性監(jiān)測系統(tǒng)的關(guān)鍵指標(biāo)細(xì)菌之一。噁唑烷酮類藥物作為治療耐萬古霉素腸球菌和耐甲氧西林金黃色葡萄球菌等革蘭氏陽性細(xì)菌的重要藥物,其耐藥性的出現(xiàn)和全球傳播已成為嚴(yán)重的全球公共衛(wèi)生問題。因此,揭示噁唑烷酮類藥物耐藥基因在腸球菌的流行傳播特征,對遏制耐藥性的發(fā)生和傳播具有重要意義。
近日,新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院夏利寧教授團(tuán)隊(duì)在Science of the Total Environment發(fā)表了題為Molecular epidemiology,phenotypic and genomic characterization of antibiotic-resistant enterococcal isolates from diverse farm animals in Xinjiang, China的研究論文,揭示了新疆動(dòng)物源耐藥腸球菌的分子流行病學(xué)、表型和基因組特征。
研究團(tuán)隊(duì)采用瓊脂稀釋法、PCR、全基因組測序和生物信息學(xué)分析等方法,對新疆7種農(nóng)場動(dòng)物(羊、雞、豬、駱駝、牛、馬、鴿)肛拭子中腸球菌的分子流行病學(xué)、表型和基因組特征進(jìn)行了研究。發(fā)現(xiàn)豬、牛和雞糞源中多重耐藥腸球菌和耐藥基因的流行率較高,腸球菌對之前用作生長促進(jìn)劑的抗生素有很高的耐藥性。多位點(diǎn)序列分型為ST714、ST1168和ST97的 optrA陽性糞腸球菌在某集約化豬場呈區(qū)域性流行。具有多個(gè)耐藥基因的質(zhì)粒是optrA基因在不同區(qū)域的人和動(dòng)物中傳播的重要載體。這項(xiàng)研究還強(qiáng)調(diào)指出,農(nóng)場動(dòng)物中的optrA陽性腸球菌能通過環(huán)境、食物消費(fèi)和其它方式給人類帶來健康風(fēng)險(xiǎn)。因此,應(yīng)在農(nóng)場動(dòng)物中加強(qiáng)耐藥監(jiān)測和其它有效的控制措施。
圖1. 7種農(nóng)場動(dòng)物腸球菌分離株的耐藥性熱圖
圖2. 12株optrA陽性糞腸球菌的系統(tǒng)進(jìn)化分析和基本信息分析
圖3. pAFL-109F和其它類似質(zhì)粒的結(jié)構(gòu)對比
新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)博士研究生陳萬昭為第一作者,夏利寧教授以及揚(yáng)州大學(xué)李瑞超教授為共同通訊作者。該研究受到國家自然科學(xué)基金(32360910)、新疆草食動(dòng)物新藥研究與創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室2023年度開放課題(XJCDVM-HDRC-T202304)的支持。本文的科學(xué)邏輯及英文寫作部分受到了我校“天山學(xué)者”及引智計(jì)劃高端外國專家王華騫教授的指導(dǎo)。