綿羊消化道線蟲（Gastrointestinal nematodes，GIN）感染是由多種線蟲寄生于胃腸道，導(dǎo)致綿羊生長發(fā)育受阻、飼料報(bào)酬降低和養(yǎng)殖成本增加，以及濫用驅(qū)蟲藥產(chǎn)生大量耐藥性蟲株,，嚴(yán)重影響?zhàn)B羊業(yè)經(jīng)濟(jì)效益,。消化道線蟲不同蟲種的繁殖力和致病性存在差異,，也是造成感染性差異的因素,。常規(guī)使用飽和鹽水漂浮法，不能準(zhǔn)確鑒定或區(qū)分不同蟲種的蟲卵或幼蟲,，且需要耗費(fèi)大量人力和時(shí)間。因此建立特異性的分子診斷方法,，為掌握綿羊消化道線蟲的分子流行病學(xué)規(guī)律及有效防治奠定了基礎(chǔ),。

近日，Experimental Parasitology 在線發(fā)表了新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)閻曉菲副教授題為“Molecular identification and phylogenetic analysis of gastrointestinal nematodes in different populations of Kazakh sheep”的研究論文,，該研究建立了綿羊消化道線蟲主要感染蟲種的分子診斷方法,，掌握了伊犁地區(qū)哈薩克羊不同群體消化道線蟲感染的分子流行病學(xué)特征和規(guī)律。

研究人員發(fā)現(xiàn),，以核糖體DNA（rDNA）的第二個(gè)內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)（ITS-2）序列作為靶序列,，對(duì)哈薩克羊及其雜交群體F1代和F2代的消化道線蟲三個(gè)優(yōu)勢蟲種,，捻轉(zhuǎn)血矛線蟲（Haemonchus contortus）、毛圓屬線蟲（Trichostrongylus spp.）,、環(huán)紋背帶線蟲（Teladorsagiacircumcincta）均能擴(kuò)增特異性ITS-2基因,。系統(tǒng)發(fā)生進(jìn)化樹表明，三個(gè)蟲種分別與NCBI公布的同種ITS-2序列聚類在同一分支,，不同科屬種的ITS-2序列聚類在不同分支,。糞樣DNA中H.contortus感染率為35.59%、Trichostrongylusspp.感染率為25.55%,、T. circumcincta感染率為11.24%,；孵化幼蟲DNA中 H.contortus感染率24.07%、Trichostrongylusspp.感染率18.89%,、T. circumcincta感染率13.26%,。三個(gè)優(yōu)勢蟲種的季節(jié)性分子流行規(guī)律呈現(xiàn)出春季顯著高于秋季和冬季，哈薩克羊及不同雜交群體的三個(gè)優(yōu)勢蟲種感染率無顯著差異,。這些結(jié)果為綿羊消化道線蟲分子流行病學(xué)監(jiān)測及其防治提供了有效的分子診斷方法,。

圖1  H.contortusITS-2序列的最大似然法系統(tǒng)發(fā)生進(jìn)化樹

圖2  Trichostrongylus spp.ITS-2序列的最大似然法系統(tǒng)發(fā)生進(jìn)化樹

圖3 T. circumcinctaITS-2序列的最大似然法系統(tǒng)發(fā)生進(jìn)化樹

新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)閻曉菲副教授為該文的第一作者，碩士研究生王鈺琪參與本研究工作,。該研究受到新疆維吾爾自治區(qū)高?？蒲杏?jì)劃項(xiàng)目（XJED2020Y049）的支持。